تبعیض بین ادیان در ایران به‌ویژه علیه بهائیان یکی از جدی‌ترین موارد نقض حقوق بشر در این کشور است.
بهائیان در ایران با انواع مختلفی از تبعیض مواجه هستند که شامل محرومیت از تحصیل، اشتغال، و حقوق شهروندی می‌شود. برای
مثال، دانشجویان بهائی از ورود به دانشگاه‌ها منع می‌شوند و حتی اگر شناسایی شوند، از تحصیل اخراج می‌گردند.همچنین، بسیاری از کسب‌وکارهای بهائیان به دستور دولت بسته می‌شود.
نمونه‌ای از این تبعیض‌ها، دستگیری‌های گسترده بهائیان به اتهامات واهی جاسوسی و تبلیغ علیه نظام است.
بسیاری از بهائیان به اتهام واهی مثل جاسوسی برای اسرائیل ویا تبلیغ علیه نظام به زندان های طولانی مدت محکوم شده‌اند، اگرچه این اتهامات بدون ارائه شواهد کافی مطرح می‌شود.
علاوه بر این، بهائیان اجازه ندارند مراسم مذهبی خود را آزادانه برگزار کنند و مکان‌های مذهبی‌شان تخریب یا مصادره می‌شود.
